Klonoví vojáci byli zrozeni pro jednu věc. Bránit republiku a vést ji k vítězství ve válce se separatisty. Válka je ale zdlouhavělá, ztráty na obou stranách rostou dennodenně. Lidé jsou unavení, rytíři Jedi jsou oslabení a jednotky klonů začnou toužit po jednom. Aby už byl konec všeho a oni se mohli začlenit jako normální lidé. Nikdo totiž netušil, že klonové dokážou cítit a chovat se jako normální lidé. Že začnou toužit po tom, mít rodinu, vlastní zázemí a žít si svůj život po svém.

Kal Skirata, seržant a současně mentor skupiny klonovaného komanda zvaní Nultí, patří mezi ty, kteří nesouhlasí s chováním kanceléře Palpatina. Palpatine ve svých klonech vidí jen obranu a posílá do války více a více klonů. Proto Skirata začne se svou skupinkou, kterou si osvojil jako své vlastní děti, plánovat útěk z republikové armády. Než ale začnou, musí najít lék. Lék na urychlený proces stárnutí klonů.

A hledání léku nebude jediným problémem, kterému budou hrdinové této knihy čelit. Republikové komando je jedna z mála knih z universa Star Wars, kde hlavní roli nemají žádné známé postavy z filmové série. Sem tam se někdo zmíní o kancléři Palpatinovi nebo o někom z Jediů, ale to je tak všechno. V této knize totiž dostávají prostor úplně jiní hrdinové. A to kloni.